《海帆第二季》讲述了一群获得了极星奖学金的学生们和极星号的船员本来打算到极星号船上横跨大西洋度过2个月的学习时光，然而瑞士日内瓦的欧洲原子能研究中心的粒子加速器在科学家们进行一场秘密实验之时出现了事故，陆地几乎全部消失了，这艘船上的人成为了全世界唯一的幸存者。从此踏上漫漫的寻找那仅存的一点陆地并重建家园的路途...可是，他们能顺利找到陆地并重建家园吗？在这艘船上的男男女女又会发生什么样的故事？