爱神巧克力进行时动画全集改编自Vivian作画的校园日常后宫体裁漫画作品。故事讲述了高一男生江浩一不小心错拿了爱神留下的“爱神巧克力”蛋糕而导致全校女生组的女生对其产生了“爱情魔法”，从而在脑内出现了错乱的爱情记忆。女生们纷繁来找他负责，为了解决这些麻烦，江浩一接收了爱神的意见协助女生们完成各种愿望来免除“爱神契约”。但得到协助的女孩子们不但没有忘掉他为自己所做的一切，还渐渐地喜欢上了这个心地善良的闷骚男……但是妹子虽好只能选择一个，究竟最后江浩一会选择谁做自己真正的真命天女呢~？